選題階段：論文的選題，也即是科研的選題，有時一項科研可產生多篇論文。選題過程一般可分為三步：

　　初擬題目：在這項工作之前必須手中有信息、資料和設想，當然可以是前瞻性研究或回顧性總結，大致可有以下幾個方面： ⑴ 臨床遇到的罕見病和疑難病例； ⑵ 危重病人的診治經驗； ⑶ 閱讀國內外文獻、參加學術會議受到的啟發，進行技術和方法的移植研究； ⑷ 新藥、新儀器的臨床應用，新的診斷方法及治療經驗； ⑸ 上級布置或招標的題目。在初步考慮擬選題目之后，應進行全面的文獻檢索，避免題目類同、結論陳舊和不符合客觀事實。在別人研究成果基礎上尋找尚未解決的問題作為自己的研究題目。

　　實驗研究階段：這包括應用國外或國內的先進手段、藥物、手術方法、檢測等進行臨床試用、觀察和隨訪調查，并用動物或正常人作對照試驗，要求詳細記錄各種數據及資料，作為論證和評價成果的依據。

　　整理、分析資料和總結階段：對以上資料進行統計分析，繪制圖表，臨床分析和比較，得出顯效、有效和生存率、死亡率、發病率等結論，并分析其相互關系，引證文獻作對比。分析成功和失敗的原因及制約因素，并對病因學、流行病學、發病機制進行論證，包括預后的估價。最后對論文作出自我評價，提出有待進一步探討的問題。

　　撰寫論文階段：該詳則祥，該簡則簡，文字簡練，用語準確，恰如其氛，切忌浮夸和虛構。當然，在產生論文以前，每位作者必須學會文獻檢索，統計學的基礎知識的 X2 檢驗、 T 檢驗、 F 檢驗、相關分析、回歸運算、如何選擇樣本大小等，努力閱讀醫學情報信息和文獻積累，在實踐中不斷總結，逐步提高寫作水平，這樣才能水到渠成寫出真正好的論文。